El Sistema de Áreas Naturales Protegidas (SANP) creado por Ley Provincial XVI-Nº 29 (antes 2932) está conformado de la siguiente manera:
| Jurisdicción | Nº de Áreas | Categoría de Manejo | Total superficie |
| Provincial | 22 | Parques Provinciales | 157.567 has. |
| Provincial | 2 | Monumentos Naturales | 416 has. |
| Provincial | 3 | Reservas Ícticas | 963 |
| Provincial | 2 | Reservas Nat. Cultural | 15.695 has. |
| Provincial | 3 | Reservas de Usos Mult. | 500 has |
| Provincial | 2 | Paisaje Protegido | 8.012 has. |
| Privada | 22 | Reservas Privadas | 10.450 has. |
| Municipal | 5 | Parque Nat. Municipal | 2.029 has. |
| Jurisdicción | Nº de Áreas | Categoría de Manejo Internacional | Total superficie |
| Provincial | 1 | (*)Reserva de Biosfera YABOTÍ | 236.313 has |
(*) En el caso de la superficie de la Reserva de Biosfera Yabotí, cabe destacar que se encuentran incluidos las siguientes ANP (PP Esmeralda, PP Moconá, PP Caá Yarí, Res Exp Guaraní,Res Cult Papel Misionero), lo cual significa que sin estas la sup sería de 183.222 has
| Jurisdicción | Nº de Áreas | Categoría de Manejo | Total superficie |
| Provincial | 1 | (*)Corredor Verde | 1.108.000 has |
| Provincial | 1 | (*)Parkway | 260.082 has |
(*) En el caso de la superficie del Corredor Verde, cabe destacar que se encuentran incluidos algunas Áreas Nat. Protegidas contempladas anteriormente.
OBS.: El Corredor Verde, y Parkway (Parque Ruta Costera Rio Uruguay), son de Jurisdicción Provincial pero no son Categorías contempladas en la Ley Provincial XVI-Nº 29 (antes 2932).
| Jurisdicción | Nº de Áreas | Categoría de Manejo | Total superficie |
| Nacional | 1 | Parque Nacional | 54.380 has. |
| Nacional | 1 | Reserva Nacional | 12.620 has. |
| Nacional | 1 | Reserva Nat. Estricta | 400 has. |
| Nacional | 1 | Monumento Natural | 50 has. |
– SUPERFICIE DE LA PROVINCIA DE MISIONES: 3.000.000 has.
– TOTAL DE SUPERFICIE APROXIMADA BAJO ALGUNA CATEGORIA DE PROTECCION AMBIENTAL: 1.394.000 has.
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